跖疣的彻底根除需要综合多种治疗方法，可予以中医治疗，并配合药物治疗、物理治疗，还可采取免疫治疗、手术治疗，从而改善情况。
1、中医治疗：中医治疗跖疣，注重辨证施治，常采用内服和外敷相结合的方法，中药方剂如木贼、香附等，具有解毒化瘀、养血散瘀等功效，有助于跖疣的消退。
2、药物治疗：外用药物如水杨酸等，可通过剥脱表皮、促进角质层脱落等方式发挥治疗作用。抗病毒药物也能有效抑制病毒复制，促进跖疣消退。
3、物理治疗：当药物治疗效果不佳时，可考虑物理治疗方法，液氮冷冻、微波热凝、激光治疗等物理疗法，通过破坏疣体组织和病毒复制所需的细胞环境，达到去除跖疣的目的，上述治疗方法通常需要在专业医疗人员的操作下进行，以确保安全有效。
4、免疫治疗：免疫治疗通过增强患者自身的免疫系统功能，达到清除病毒和治愈跖疣的目的，常用的免疫治疗方法包括干扰素等，但需在医生指导下进行。
5、手术治疗：对于较大的跖疣或药物治疗、物理治疗均无效的换着，手术治疗是最后的选择。手术切除、腐蚀、刮除等方法可以直接去除疣体，但术后需注意伤口护理和抗感染治疗，以防止瘢痕形成和复发。
跖疣患者应每天清洁患处，避免细菌滋生，使用温和的清洁产品，并轻轻擦干，保持患处干燥，穿着柔软、透气的鞋袜，避免过硬或过紧的鞋子对患处造成压迫和摩擦，有助于减轻症状并防止感染。